古代司法权限不明确的情况下，这三个部门的职权有很多重合的地方，因此才有了三法司的统称！
明朝的时候因为有东厂、锦衣卫这样皇家掌握的特务机关，三法司的职能其实被削弱了不少，在厂卫权势煊赫的时候，东厂、锦衣卫根本不用请旨，更不用通过三法司，就能直接通过司礼监发驾帖抓人，并且锦衣卫还设有诏狱，抓了人直接送入诏狱刑讯、定罪、处决直接就办了，可以说是一个完独立的司法体系！
今天朱由校的话很明显是剥夺了东厂和锦衣卫私自定罪、判决的特权，这无疑是对这两个大明特有的特务机构极大的削弱，王安和骆思恭不知道朱由校要干什么，但他们是皇帝的奴仆和近卫，所以不可能提出反对意见，只能满脸震惊地应是！
朱由校看了看有些震惊的王安，又对骆思恭说道：“锦衣卫原本的南北镇抚司也要分开，南镇抚司彻底明面化，先从京畿周围开始，负责缉盗捕匪，维护地方治安，慢慢的南镇抚司的职权要扩大的整个大明朝，取代现有的衙门差役，不过这事的慢慢来，先不用着急。北镇抚司则要彻底隐于暗处，并且面对外，孤要北镇抚司的人在一年之内打入东虏、蒙古内部，一年之后努尔哈赤每天吃什么、喝什么、说什么，睡哪个女人，甚至穿什么颜色的内裤，孤都要知道的一清二楚，这是当务之急你们锦衣卫要着重去做！”
王安本来对权柄并不看中，因此听了朱由校的安排只是有些震惊，并没有什么太大的反应，不过骆思恭却被朱由校的计划给吓傻了，按照朱由校的想法，未来国各地的治安将部移交到锦衣卫治下，光这一项权利，就能让任何一位锦衣卫指挥使天天提着脑袋睡觉了！
至于说往辽东和蒙古派出探子的事情，这其实也是锦衣卫分内的事情，只不过这些年这件事荒废了许多，以至于东虏做大，朝廷竟然对东虏的实力、动向、意图一无所知，这才处处被动！
最终导致了萨尔浒大败，不但如此，东虏还渗透了很多探子到辽东各城之中，朝廷大军动向都摆在人家眼皮子底下，很多时候都吃亏在这个上面，因此骆思恭倒是很赞成朱由校对东虏加强渗透的做法！